Het microbioom is de verzameling van micro-organismen (ook wel microbiota of microflora genoemd) in en op je lichaam. Hiertoe behoren bacteriën, schimmels, virussen, gisten en andere micro-organismen. Zo draag je meer dan honderdduizend miljard micro-organismen bij je. Je darmflora levert het grootste aandeel van het microbioom.
Hoewel lange tijd gedacht werd dat micro-organismen vooral schadelijk zijn voor de gezondheid, weten we sinds kort dat veel van deze micro-organismen juist bijdragen aan de gezondheid. Zo kunnen micro-organismen de vezels fermenteren die je eigen lichaam niet kan verteren. Verder stimuleren ze de darmperistaltiek, oftewel de darmbeweging die de voedselbrij voortduwt, beschermen ze de darmwand en trainen ze het afweersysteem.
De samenstelling van de micro-organismen die je bij je draagt verandert voortdurend. Factoren die de samenstelling beïnvloeden zijn onder andere je voedingspatroon en sportactiviteit. Het microbioom verschilt van mens tot mens, waardoor ieder mens uniek is in zijn of haar microbioomsamenstelling.
Onderzoekers zijn hard bezig om meer te weten te komen over de functie van het microbioom. Het microbioom wordt steeds vaker in verband gebracht met chronische ziekten en er wordt zelfs gedacht dat het microbioom effect heeft op het brein.