Karnemelk is een mager melkproduct en past daarom binnen een gezond voedingspatroon. Karnemelk is dus laag in verzadigd vet. Tegelijkertijd is karnemelk rijk aan eiwit, calcium, fosfor en vitamine B2. De kwaliteit van melkeiwit is relatief hoog vanwege de grote hoeveelheid essentiële aminozuren die het bevat.
Doordat karnemelk gefermenteerd is, bevat het melkzuurbacteriën die bijdragen aan een gezonde darmflora. Deze melkzuurbacteriën behoren dan ook tot de probiotica. Daarnaast is karnemelk ook geschikt voor mensen met een lactose intolerantie, omdat de lactose voor een groot deel is omgezet door de melkzuurbacteriën.
