Grote hoeveelheden van bestrijdingsmiddelen zijn schadelijk voor de gezondheid. Echter, residuen van bestrijdingsmiddelen op bijvoorbeeld groenten en fruit zijn veilig om te consumeren. De hoeveelheden waarbij bestrijdingsmiddelen wel of niet schadelijk zijn, worden bepaald en vastgelegd in de Wet Gewasbeschermingsmiddelen en Biociden (Wgb). Om deze wet te waarborgen worden er onder andere veel controles uitgevoerd door het bedrijfsleven en door de Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit (NVWA). Uit de controles van het NVWA blijkt dat 98% producten voldoen aan de wettelijke eisen van Wgb.
Een persoon kan te veel residuen van bestrijdingsmiddelen binnenkrijgen door het het eten van veel producten waarbij vergelijkbare bestrijdingsmiddelen gebruikt zijn. Mogelijke gezondheidsklachten die dan ontstaan zijn misselijkheid en hoofdpijn. Er wordt veel onderzoek gedaan om dit zogenoemde cumulatieve effect mee te nemen in de wetgeving voor het toelaten van bestrijdingsmiddelen.
Tot slot kunnen de toegelaten bestrijdingsmiddelen niet in het lichaamsvet ophopen.
